Здесь устраивают выставки, многие из которых уникальны. Такие экспозиции могут быть интересны будущим археологам, историкам, краеведам, филологам.
Государственный историко-художественный музей «Новый Иерусалим» — один из крупнейших региональных музеев. Он связан с уникальным памятником — Воскресенским Ново-Иерусалимским монастырем. В настоящее время собрание музея насчитывает более 180 тысяч единиц хранения и включает коллекции археологических и этнографических материалов, письменных источников и фотодокументов, рукописей и редких книг, нумизматики, оружия, русских и зарубежных изобразительных материалов разных эпох. По содержанию коллекции отражают историческое и культурное развитие Московского региона, начиная с его заселения и до наших дней. В музейное собрание входят и уникальные реликвии, напрямую связанные с историей Воскресенского Ново-Иерусалимского монастыря и личностью его основателя — патриарха Московского и всея Руси Никона (1605—1681).
А по данным АИС «Статистика» министерства культуры РФ и по версии международной газеты The Art Newspaper Государственный историко-художественный музей «Новый Иерусалим» в подмосковной Истре стал лидером рейтинга самых посещаемых художественных музеев в регионах России.
«Наш музей „Новый Иерусалим“ — первый в рейтинге самых посещаемых художественных музеев в регионах по версии газеты The Art Newspaper! Приглашаю всех увидеть его своими глазами!» — написал губернатор Московской области Андрей Воробьев в своем Instagram-аккаунте.
На данный момент в музее открыты три новые выставки: «Скрытые пространства» современного испанского художника и фотографа Хосе Мануэля Баллестера, «Константин Горбатов. Приближая красоту» , приуроченная к 145-летию мастера русского импрессионизма Константина Горбатова (1876—1945), а также выставка Русского географического общества «Монастыри России» , где представлены впечатляющие снимки финалистов и победителей ежегодного фотоконкурса РГО «Самая красивая страна».
Уже завоевавшая популярность у посетителей уникальная выставка «Возвращение в усадьбу» продлена до 3 октября 2021 года, на ней можно увидеть разнообразные усадебные коллекции музея — живопись, графику, декоративно-прикладное искусство, архивные материалы — всего более 400 предметов из собственного музейного собрания и частных коллекций.