В галерее Музея «Новый Иерусалим» раздел «Церковное искусство XVI–XIX веков» раскрывает эволюцию русского церковного искусства на протяжении четырёх столетий. Музей представляет 79 лучших произведений из собственного собрания. Это работы строгановских иконописцев и изографов Оружейной палаты, иконы, выполненные мастерами Русского Севера и Поволжья. Экспозиция включает богородичные иконы и образы Спасителя в разных, в том числе редких, изводах, праздничные иконы и образы святителей. Проект раскрывает стилистическое и иконографическое многообразие русского церковного искусства, а также творческие поиски мастеров, работавших в едином русле христианских традиций.
Музейное собрание икон насчитывает около 300 памятников XVI–XIX веков. Коллекция сформировалась благодаря активной собирательской деятельности музея после Великой Отечественной войны. Существовавшее ранее музейное собрание, основу которого составляли произведения из Воскресенского Ново-Иерусалимского монастыря, почти полностью погибло в 1941 году. Тем не менее музей продолжает открывать свои фонды и удивлять знатоков церковного искусства.
Экспозиция размещена в трёх залах. Её открывают богородичные иконы и образы Спасителя, в том числе древнейшие и редкие варианты изображений. Музей экспонирует старинные иконы, сохранившиеся в довоенной коллекции. Среди ценнейших экспонатов — произведения XVI века «Богоматерь Одигитрия» и «Господь Вседержитель».
Древняя русская иконопись по большей части — анонимное искусство. Тем не менее музей располагает редкими подписными экземплярами, которые можно увидеть на выставке. Например, это образ Господа Вседержителя, выполненный Иваном и Василием Москвитиными в 1681 году, и Казанская икона Божией Матери, написанная московским мастером Феодотом Феофановым Ухтомским в 1724 году. Происхождение некоторых произведений научные сотрудники музея установили благодаря близким стилистическим аналогиям.
Затем экспозиция показывает большой период в истории русской иконописи — от эпохи позднего Средневековья до последних десятилетий Нового времени. Здесь представлены образы святых, написанные изографами разных художественных центров.
Среди изображений восточно-христианских святых — иконы святителя Николая Чудотворца, священномученика Власия Севастийского, которого почитали как охранителя домашних животных, и мучеников Гурия, Самона и Авива — покровителей семейного благополучия. В разных иконографических изводах изображён пророк и креститель Иоанн Предтеча.
Образ предводителя небесного воинства Архистратига Михаила запечатлён на небольшой аналойной иконе на фоне архитектурного пейзажа. Она выполнена в традициях школы Оружейной палаты.
В экспозиции представлены иконы «Избранные святые в молении Спасителю» и «Праведный Симеон Богоприимец и мученик Иоанн Воин в молении Тихвинской иконе Богоматери». К редким образам относится икона «Преподобный Алексий, человек Божий, с 12 клеймами жития и избранными святыми на полях» из коллекции музея. Она написана северным мастером в конце XVIII века.
Завершает экспозицию прекрасный пример русского церковного искусства эпохи барокко — комплекс из четырёх храмовых икон из иконостаса церкви Вознесения села Воскресенское Ногинского района Московской области.
Новый выставочный проект позволяет увидеть как иконописные произведения, созданные мастерами различных центров, так и объёмные скульптурные иконы, проследить особенности развития русского церковного искусства и оценить высочайший уровень мастерства русских художников.